您的这个问题提得很好。其实在基层，这方面早已不是什么问题了，有很多地区就明确规定可以间作矮棵农作物，但各地的政策规定不很一致。

依我看，您还是按地方的政策规定办。

在退耕还林条例中的相关规定中，有不得间作套种的规定，但那时出台这个规定的背景，主要是担心退户在得到了退耕补助，以间作套种为借口，继而进行复耕。

退耕还林条例是法规、这次的通知是政策，这也算是中国的特色之一，法规有效、政策也有效；但，在执行（操作）中以最近、最新的为准。条例在先、通知在后，现在应该执行这一通知了。也就是说，在退耕还林中的间作、套种问题上，国务院已经“解冻”了。

但，这有一个前提，不得复耕，不得“破坏植被、造成新的水土流失”。